Обратимся к НК РК.
Согласно п.1 ст.213 НК РК, налогоплательщик может на основании налогового заявления в УГД МФ РК:
- приостановить представление отчетности;
- продлить срок приостановления представления отчетности;
- возобновить представление отчетности.
При этом, согласно пп. 57 п.1 ст.11 НК РК, налогоплательщик - лицо или структурное подразделение (филиал) юридического лица, являющиеся плательщиком налогов и других обязательных платежей в бюджет. Следовательно, все зависит от того, является ли филиал самостоятельным налогоплательщиком.
ТОО своим решением вправе признать налоговым агентом свой филиал по доходам, облагаемым у источника выплаты, а также по ИПН у источника выплаты, по соцналогу, по удержанию ОПВ и уплате соцотчислений по работникам филиала, по транспортному налогу и налогу на имущество.
Если филиал признан самостоятельным плательщиком налогов, то можно приостановить его деятельность. Если же филиал не является самостоятельным подразделением и головная организация выполняет функции налогового агента, то деятельность филиала нельзя приостановить. Можно только полностью закрыть филиал.
При этом отметим, что если у филиала отсутствуют объекты обложения (например, доход) то можно не закрывая филиал сдавать отчеты «пустографки». Такой вариант законодательством не запрещен.