Согласно п.2 ст.456 НК РК при импорте товаров на территорию Казахстана с территории стран ЕАЭС налогоплательщик обязан представить в УГД МФ РК по месту нахождения (жительства) заявление по ф.328.00:
- на бумажном носителе и в электронной форме;
- либо только в электронной форме.
Форма сдается не позднее 20 числа месяца, следующего за налоговым периодом.
Согласно пп.4 п.7 ст.74 НК РК местом нахождения юрлица-резидента и его структурного подразделения (филиала) место нахождения его постоянно действующего органа, внесенное в Национальный реестр БИН.
Таким образом, если филиал не зарегистрирован как самостоятельный налогоплательщик, ф.328.00 сдается по месту нахождения головного ТОО.