Согласно п.1 ст.400 НК РК, суммой НДС, относимого в зачет, признается сумма НДС, подлежащего уплате за полученные товары и услуги, если они используются или будут использоваться в целях облагаемого оборота.
В случае приобретения товаров, работ или услуг у нерезидента, такая сумма должна быть указана в декларации по НДС (пп.3 п.1 ст.400 НК РК), но не более суммы НДС, указанной в платежном документе, подтверждающем уплату НДС.
Учитывается НДС от нерезидента, в случае отнесения его в зачет, в том налоговом периоде, к которому относится более поздняя из следующих дат (п.3 ст.401 НК РК):
- дата уплаты НДС в бюджет;
- последний день квартала, за который исчислен налог.
Таким образом, уплаченный НДС за нерезидента казахстанская компания вправе относить в зачет, при условии, что приобретенные товары и услуги будут использоваться в целях облагаемого оборота.